【格局在线专讯】上周日在北地发现一宗COVID-19病例时,奥特罗阿(Aotearoa,毛利语,指新西兰)第二个很长时间未发现社区病例的时期就此结束。奥克兰大学高级讲师戴维·韦尔奇(David Welch)今天在观点网站发表署名文章,对新西兰目前的疫情防控表达了个人观点。以下为全文照译:
ESR(新西兰皇家研究所)科学家一直工作到周日晚上,以获得完整的基因组序列,并在周一早上报告说,这是自12月中以来我们听到的很多“关注变体”之一。
到目前为止,受感染妇女的密切接触均已被证实为阴性。但这是自8月以来发现的第九次社区入侵。使用新西兰最大城市的酒店的临时托管隔离和检疫(MIQ)系统,而不是专门建造的防控设施,预计还会有更多的社区病例出现。
而且全球范围内新变种的流行程度越来越高,这意味着我们不可避免地最终会在社区中再看到新变种。除非边界有重大改善,否则我们会期待更多此类情况。
我们应该如何关注?
简而言之,共有三种变体,它们在基因组区域共享一个共同的突变,即501Y,该突变编码刺突蛋白-病毒与我们细胞结合并感染的部分。
这三个变体最简单地称为501Y-V1(或B.1.1.7,在英国首次检测到);501Y-V2(B.1.351,在南非检测到)和501Y-V3(P1或B.1.1)。 28.1,首次在巴西发现)。
尽管在多个国家多次看到501Y突变,但让这三个变体格外引人关注的是,它们都伴随着其他多个突变,这些突变是其他地方看不到的。
人们认为,这些突变的综合作用有助于病毒更快速地传播,并有可能帮助其逃避我们免疫反应的某些部分。非常早期和不完整的证据表明,它们可能比原始病毒造成更大的死亡风险。
传播增加的风险
我们试图确定一种变种的传播速度是否比其他任何一种都快。但影响病毒传播的因素范围很广,并且涉及很多随机机会。
在12月之前,只有证据表明一种变异体-峰值蛋白突变614G-可能具有更高的传播率。现在这是全球范围内的主要菌株。
但是,当它传播到新的肥沃的土地再进行传播时,它可能通过简单的运气就达到了目前的主导地位。去年的大部分时间里,科学家们都在搁置有关新突变正在改变疫情动态的建议。
来自英国的报告501Y-V1是第一个引起关注的变体,从而改变了这一情况。这是一个变体,与同一个地方的许多其他菌株竞争-而且它的增长速度似乎要快得多。
冬天起着作用
我们可以将病毒传播视为一棵树,新的感染是分支的萌芽,而当前情况是这些分支的尖端。如果我们看到100个分支,一个变体中的50个,另一个变体中的50个,成长为200个分支,那么我们期望每个变体大约有100个。
在英国采样的病毒病例的全基因组序列,使研究人员能够构建病毒的家族树并观察其生长。他们观察到的是501Y-V1超出了其他变体:拆分更像是115 501Y-V1分支和85个其他类型的分支。
当然,这里也可能涉及机会。影响传播的最大因素是我们作为社会如何通过预防措施做出反应。人们也越来越认识到季节性的影响。
随着英国变种的传播,随着冬天的来临,病例增多,学生重返学校……病例数量的增长不足为奇。
但是现在已经反复观察到501Y-V1的更高的增长率。估计其传播高于通常的30-70%左右。
在南非的501Y-V2中也观察到快速生长,遗传相似性表明501Y-V3也可能具有此特征。
已知的未知数
在将这些数字转移到其他环境时,我们应该谨慎。英国处于相当高的戒备水平,将标准菌株的繁殖数量(或R数量,即每个感染者预期感染的平均人数)降低到大约0.9。
501Y-V1的R值大于1,约为1.2至1.5,因此声称它的差值高达70%。但是,根据英国数据,尚不清楚效果是相乘的(意味着我们将观察到的R数乘以170%),还是相加的(我们只是将较高和较低R数之间的差相加即可进行调整,因此最高为0.6)。
如果现在在新西兰没有发现暴发,鉴于我们的限制非常少,而且是在夏天,那么标准病毒的R值可能在2左右。70%的乘积效应会将R增加到3.4,而相加效应将只需添加相同的数量-0.6-在受限的英国环境中即可看到,R为2.6。
2、2.6和3.4之间的差异似乎很小。但是从一个病例开始传播了四个星期之后,新病例可能有30、120和450个差异。
新西兰现在可以做什么?
随着新西兰进入秋季和冬季的凉爽天气,背景R值将逐渐增加。
到目前为止,我们对第一波以来发现的社区病例感到有些幸运。除了8月份奥克兰疫情的显著例外外,索引(编号)病例始终得到迅速识别,并与边境相关联,并没有成为超级传播者。
尽管许多涉及到的个案都尽早采取了正确的措施,但在某些时候,我们的“愚蠢的好运”可能会用光,并引发一个超级传播事件。
据估计,大约15-20%的病例是超级传播者,这些病例导致70-90%的感染。根据这些估计,从九次边境输入病例统计中可以看到一次大暴发。
减少快速暴发风险的最明显和最便宜的方法,是减少从高风险国家返回的人数(尽管不一定是总人数)。
我们还可以通过增加额外的隔离后测试要求,并让那些离开隔离区的人严格限制其在社区第一周的联系,来减少发生超级传播事件的机会。
David Welch, is a Senior Lecturer at the University of Auckland. This article is republished from The Conversation under a Creative Commons license. Read the original article.